中大新聞網(wǎng)訊（康峻鳴）附屬第一醫(yī)院呂萬(wàn)革教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合張弩教授團(tuán)隊(duì)系統(tǒng)性繪制膠質(zhì)瘤功能性增強(qiáng)子互作圖譜，解析風(fēng)險(xiǎn)SNP驅(qū)動(dòng)的促腫瘤機(jī)制，相關(guān)研究成果發(fā)表于《Nature Cell Biology》（自然-細(xì)胞生物學(xué)）。
神經(jīng)膠質(zhì)瘤（Glioma）是侵襲性強(qiáng)的中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤，五年生存率不足10%。盡管全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）已發(fā)現(xiàn)多個(gè)與風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的非編碼區(qū)域的單核苷酸多態(tài)性（SNP），其致病機(jī)理仍不清楚。
該研究通過(guò)結(jié)合高通量CRISPRi與H3K27ac HiChIP技術(shù)，系統(tǒng)繪制膠質(zhì)瘤增強(qiáng)子互作網(wǎng)絡(luò)，精準(zhǔn)配對(duì)促腫瘤增強(qiáng)子與遠(yuǎn)端靶基因。團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)多數(shù)已報(bào)道風(fēng)險(xiǎn)SNP位于增強(qiáng)子。以rs2297440為例，該位點(diǎn)所在增強(qiáng)子雖位于RTEL1內(nèi)含子區(qū)域，卻通過(guò)三維染色質(zhì)與SOX18相互作用驅(qū)動(dòng)其表達(dá)；敲除增強(qiáng)子或?qū)L(fēng)險(xiǎn)等位基因單堿基編輯為非風(fēng)險(xiǎn)形式，均降低增強(qiáng)子互作與腫瘤細(xì)胞增殖。機(jī)制上，轉(zhuǎn)錄因子MEIS1偏好結(jié)合風(fēng)險(xiǎn)等位基因并上調(diào)SOX18，形成“rs2297440–MEIS1–SOX18”促腫瘤機(jī)制。
本研究提供了膠質(zhì)瘤增強(qiáng)子連接組資源，闡明非編碼變異如何重塑遠(yuǎn)程調(diào)控并推動(dòng)腫瘤進(jìn)展，為精準(zhǔn)治療提供潛在靶點(diǎn)。
附屬第一醫(yī)院呂萬(wàn)革教授、張弩教授和蘇光松副教授為該論文的通訊作者，附屬第一醫(yī)院博士后畢進(jìn)方、莫偉鵬、南開(kāi)大學(xué)已畢業(yè)博士生劉滿(mǎn)為該論文共同第一作者。
